微囊藻群体总RNA提取方法的比较
  • 【DOI】

    10.18307/2018.0215

  • 【摘要】

    微囊藻群体富含多糖类物质是影响微囊藻RNA提取的关键因素.为了获得高质量的微囊藻群体总RNA,对比分析4种针对多糖含量较高的方法——方法1 PGTX-bead法、方法2 CTAB-bead法、方法3 FastRNA(R) Pro Blue Kit和方法4RNeasy Mini Kit对微囊藻群体总RNA的提取效果.采用琼脂糖凝胶电泳检测微囊藻群体RNA的完整性,NanodropND1000分光光度... 展开>>微囊藻群体富含多糖类物质是影响微囊藻RNA提取的关键因素.为了获得高质量的微囊藻群体总RNA,对比分析4种针对多糖含量较高的方法——方法1 PGTX-bead法、方法2 CTAB-bead法、方法3 FastRNA(R) Pro Blue Kit和方法4RNeasy Mini Kit对微囊藻群体总RNA的提取效果.采用琼脂糖凝胶电泳检测微囊藻群体RNA的完整性,NanodropND1000分光光度计检测RNA纯度及浓度,并采用qPCR检测DNA污染情况.结果表明,4种方法都能从微囊藻群体中提取获得RNA,并在去除DNA后都可以进行RT-PCR等后续实验.方法1 PCTX-bead提取的RNA产量最高,纯度好,DNA污染小,成本低,适合从微囊藻群体中大量提取RNA;方法2 CTAB-bead提取的RNA样品产量也较高,但DNA污染严重,适合需要同时提取DNA和RNA的样本;方法3 FastRNA(R)Pro Blue Kit和方法4 RNeasy Mini Kit提取的RNA产量都较低,但方法4操作简单,耗时短,所检测目的基因的相对表达量较高,更适合从少量的微囊藻群体中提取总RNA. 收起<<

  • 【作者】

    高胜玲  黄亚新  卢亚萍  施丽梅  孔繁翔  张小倩 

  • 【作者单位】

    南京农业大学生命科学学院/南京农业大学生命科学学院/中国科学院南京地理与湖泊研究所湖泊与环境国家重点实验室

  • 【刊期】

    湖泊科学 ISTIC PKU 2018年2期

  • 【关键词】

    微囊藻群体  RNA提取  qPCR  多糖  Microcystis colonies  RNA extraction  qPCR  polysaccharide 

  • 【基金项目】

    国家自然科学基金项目 江苏省自然科学基金项目