基于PCR-DGGE技术的剑湖湿地湖滨带土壤微生物群落结构多样性分析
  • 【DOI】

    10.11654/jaes.2013.07.018

  • 【摘要】

    为了解剑湖湿地湖滨带植物根际土壤中细菌的群落结构特征多样性,应用PCR-DGGE技术对剑湖湿地湖滨带4种植物根际土壤细菌的群落结构进行了研究,根据DGGE指纹图谱,对它们的遗传多样性进行了分析.结果表明,不同植物群落根际和非根际土壤细菌多样性指数(H′)、丰度(S)和均匀度(J)均有所不同,根际土壤细菌多样性指数、均匀度、丰富度均高于非根际,其中茭草根际土壤细菌多样性指数、均匀度、丰富度均最高,说... 展开>>为了解剑湖湿地湖滨带植物根际土壤中细菌的群落结构特征多样性,应用PCR-DGGE技术对剑湖湿地湖滨带4种植物根际土壤细菌的群落结构进行了研究,根据DGGE指纹图谱,对它们的遗传多样性进行了分析.结果表明,不同植物群落根际和非根际土壤细菌多样性指数(H′)、丰度(S)和均匀度(J)均有所不同,根际土壤细菌多样性指数、均匀度、丰富度均高于非根际,其中茭草根际土壤细菌多样性指数、均匀度、丰富度均最高,说明植物群落类型与土壤微生物多样性的关系十分密切;不同植物群落根际土壤细菌群落结构相似性较高,非根际土壤细菌群落结构相似性较低,在82%的相似水平上聚为4大类群,根际土壤细菌和茭草非根际土壤细菌聚为一类,其余非根际土壤细菌各聚为一类,说明植物群落对微生物群落结构具有一定的影响.对DGGE的优势条带序列分析,同源性最高的微生物分别属于变形菌门(Proteobacteria)、草酸杆菌科(Oxalobacteraceae)、紫色杆菌属(Janthinobacterium)、杜擀氏菌属(Duganella)、埃希氏菌属(Escherichia)和链球菌属(Streptococcus),它们均为未培养微生物.不同植物群落根际土壤氮磷含量均有所差异,其中茭草根际土壤氮磷含量最高,湿地土壤细菌多样性与土壤有机质、总N、总P的含量呈正相关关系,土壤细菌多样性与土壤pH值呈负相关关系. 收起<<

  • 【作者】

    刘绍雄  王明月  王娟  杨宇明  缪福俊  王金华  张敬宜  熊智 

  • 【作者单位】

    西南林业大学/云南省林业科学院

  • 【刊期】

    农业环境科学学报 ISTIC PKU 2013年7期

  • 【关键词】

    PCR-DGGE  剑湖湿地  根际微生物  多样性  PCR-DGGE  Jianhu wetland  rhizosphere microorganisms  diversity 

  • 【基金项目】

    国家自然科学基金项目 国家重点基础研究发展计划973前期研究专项 云南省中青年学术技术带头人后备人才培养项目 云南省西南林业大学生物技术特色专业建设项目 云南省教委湿地生态学创新团队项目资助