椒江口海域沉积物微生物群落及其对环境因子的响应
  • 【DOI】

    10.19316/j.issn.1002-6002.2017.06.12

  • 【摘要】

    微生物群落在有机污染物生物地球化学循环中起着十分关键的作用.微生物群落结构和多样性及其变化在一定程度上反映了土壤的质量.宏基因组学能够在整体水平解析微生物群落结构,真实地揭示原位环境中微生物群落的复杂性和多样性.应用Illumina MiSeq宏基因组高通量测序技术,在椒江口海域沉积物中鉴定得到古菌和细菌共33门类,变形菌门为明显的优势门类,其序列数占总数的62.1%.其他较为丰富的门类包括绿弯菌... 展开>>微生物群落在有机污染物生物地球化学循环中起着十分关键的作用.微生物群落结构和多样性及其变化在一定程度上反映了土壤的质量.宏基因组学能够在整体水平解析微生物群落结构,真实地揭示原位环境中微生物群落的复杂性和多样性.应用Illumina MiSeq宏基因组高通量测序技术,在椒江口海域沉积物中鉴定得到古菌和细菌共33门类,变形菌门为明显的优势门类,其序列数占总数的62.1%.其他较为丰富的门类包括绿弯菌门、放线菌门、拟杆菌门.采用mothur软件计算Ace、Chao、Shannon、Simpson指数,结果发现,Ace、Chao的均值分别为511、518,Shannon在5.0左右,Simpson接近于0.02,显示出海域沉积物中微生物多样性较高且差异较小.通过微生物门类多样性与环境因子的相关性分析发现,PCB101、盐度和γ-氯丹对微生物门水平的群落分布具有显著性影响.计算微生物门类组成与环境因子间Spearman相关系数井绘图分析,温度、盐度、pH与多个微生物门类的组成和分布呈现明显的相关关系. 收起<<

  • 【作者】

    黄备  邵君波  周斌  孟伟杰  罗韩燕 

  • 【作者单位】

    浙江省舟山海洋生态环境监测站/杭州师范大学

  • 【刊期】

    中国环境监测 ISTIC PKU 2017年6期

  • 【关键词】

    宏基因组  高通量测序  海洋沉积物  微生物群落  椒江口  metagenomics  high throughout sequencing  marine sediment  microbial community  Jiaojiang Estuary 

  • 【基金项目】

    国家重点研发计划 国家自然科学基金资助项目 浙江省科技厅公益重点项目 浙江省环保厅科研项目