基于454高通量测序的黄土高原不同乔木林土壤细菌群落特征
  • 【摘要】

    选取黄土高原不同乔木林(辽东栎, LDL;侧柏, CB;刺槐, CH;油松, YS)表层土壤为研究对象,利用第二代高通量测序技术罗氏454平台对其进行16S rRNA基因V1~V3可变区测序,通过分析其Alpha多样性、物种组成和丰度、群落结构,结合土壤的理化性质研究其对细菌群落结构的影响。结果表明:所有土壤样品共检测到36个门,84个纲,187个目。不同乔木林土壤中优势菌来自变形菌门(Prote... 展开>>选取黄土高原不同乔木林(辽东栎, LDL;侧柏, CB;刺槐, CH;油松, YS)表层土壤为研究对象,利用第二代高通量测序技术罗氏454平台对其进行16S rRNA基因V1~V3可变区测序,通过分析其Alpha多样性、物种组成和丰度、群落结构,结合土壤的理化性质研究其对细菌群落结构的影响。结果表明:所有土壤样品共检测到36个门,84个纲,187个目。不同乔木林土壤中优势菌来自变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、绿弯菌(Chloroflexi)和浮霉菌门(Planctomycetes),主要的优势菌纲为放线杆菌纲(Actinobacteria)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、酸杆菌(Acidobacteria)、β-变形菌纲(Betaproteobacteria)、浮霉菌纲(Planctomycetacia)。不同乔木林土壤中绿弯菌门(Chloroflexi)与pH值呈极显著的正相关,总磷和蓝细菌(Cyanobacteria)呈极显著的正相关,微生物生物量碳与芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)呈极显著的负相关,土壤总磷含量可能为CB样地区别于其他土样群落组成的主要因素。 LDL样地细菌群落受环境影响较小。 收起<<

  • 【作者】

    刘洋  曾全超  黄懿梅 

  • 【作者单位】

    西北农林科技大学资源环境学院

  • 【刊期】

    中国环境科学 ISTIC EI PKU 2016年11期

  • 【关键词】

    454高通量测序  子午岭  不同乔木林  土壤细菌  环境因子  454 high-throughput sequencing  Ziwuling mountain  different arbor forests  soil bacteria  environment factors 

  • 【基金项目】

    国家自然科学基金 水利部公益性行业科研专项经费项目 新世纪优秀人才支持计划